Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
CRXO43186 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CRXO43186 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CRXO43186 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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