Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
J3KRW8 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
J3KRW8 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
J3KRW8 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
J3KRW8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
J3KRW8 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
J3KRW8 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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