Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAPPC2LH3BP13 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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