Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
TNXAQ16473 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
TNXAQ16473 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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