Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPIDRQ14159 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPIDRQ14159 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPIDRQ14159 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SPIDRQ14159 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPIDRQ14159 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SPIDRQ14159 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SPIDRQ14159 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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