Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CDK13Q14004 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
CDK13Q14004 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CDK13Q14004 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CDK13Q14004 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CDK13Q14004 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CDK13Q14004 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms