Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
APOFQ13790 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms