Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
IFFO1Q0D2I5 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms