Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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GTF3C6Q969F1 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GTF3C6Q969F1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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GTF3C6Q969F1 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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GTF3C6Q969F1 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GTF3C6Q969F1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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