Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ZNF239Q16600 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms