Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HMGN3Q15651 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HMGN3Q15651 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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