Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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