Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
ATRQ13535 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
ATRQ13535 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
ATRQ13535 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
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