Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
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TCOF1Q13428 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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TCOF1Q13428 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
TCOF1Q13428 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
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TCOF1Q13428 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
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TCOF1Q13428 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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TCOF1Q13428 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
TCOF1Q13428 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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