Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
PTPRMP28827 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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PTPRMP28827 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
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PTPRMP28827 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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PTPRMP28827 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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PTPRMP28827 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
PTPRMP28827 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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