Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SNRNP35Q16560 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SNRNP35Q16560 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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