Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
KARSQ15046 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KARSQ15046 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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