Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms