Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SMCO1Q147U7 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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SMCO1Q147U7 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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SMCO1Q147U7 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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SMCO1Q147U7 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
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SMCO1Q147U7 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SMCO1Q147U7 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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