Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMC1AQ14683 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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