Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CUL1Q13616 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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