Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
CHAF1AQ13111 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHAF1AQ13111 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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