Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms