Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CLPPQ16740 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CLPPQ16740 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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