Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SCARF1Q14162 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SCARF1Q14162 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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