Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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