Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
EHD3Q9NZN3 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
EHD3Q9NZN3 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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