Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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