Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
SNRNP35Q16560 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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