Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CACNA1CQ13936 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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