Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CUL1Q13616 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CUL1Q13616 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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