Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTP4A2Q12974 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTP4A2Q12974 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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