Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Homer1Q9Z2Y3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms