Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria3Q9Z2W9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gria3Q9Z2W9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms