Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn8Q9Z260 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn8Q9Z260 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms