Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stk39Q9Z1W9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms