Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ap3b1Q9Z1T1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms