Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lgr5Q9Z1P4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms