Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms