Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms