Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VapaQ9WV55 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VapaQ9WV55 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms