Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms