Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lemd3Q9WU40 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lemd3Q9WU40 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms