Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Scnn1gQ9WU39 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scnn1gQ9WU39 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scnn1gQ9WU39 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scnn1gQ9WU39 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scnn1gQ9WU39 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scnn1gQ9WU39 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms