Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn4Q9WU22 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms