Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Spo11Q9WTK8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms