Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam50bQ9WTJ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam50bQ9WTJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms