Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms