Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slit2Q9R1B9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slit2Q9R1B9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms