Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mpdu1Q9R0Q9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mpdu1Q9R0Q9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms